在生命科学研究不断向精准化、量化与临床转化推进的今天，靶向蛋白质组学（Targeted Proteomics）以其高灵敏、高特异性与高重复性的特征，已成为蛋白质组学走向临床的重要工具。它是连接“组学发现”与“实际应用”的关键桥梁，特别适用于疾病标志物验证、药效学研究、免疫监测和质量控制等领域。

一、什么是靶向蛋白质组学？

靶向蛋白质组学以质谱为核心检测手段，其共同特征是对目标肽段进行事先选择、再进行特异性采集与定量。当前常用的三种策略包括：

1、MRM/SRM（Multiple/Selected Reaction Monitoring）：基于三重四极杆质谱，监测设定的前体-产物离子对，广泛用于高通量、多样本验证；

2、PRM（Parallel Reaction Monitoring）：基于高分辨率质谱（如Orbitrap），对目标前体离子所有碎片进行并行扫描，提高特异性与数据再利用能力；

3、SWATH-MS（Sequential Window Acquisition of All Theoretical Fragment Ions）：一种数据非依赖采集（DIA）策略，通过滑动窗口采集全范围碎片信息，后期可实现类靶向定量分析。

值得注意的是，SWATH技术虽然具备靶向分析能力，但其本质属于DIA技术范畴，实际应用中常用于靶标初筛与中通量定量。

二、靶向蛋白质组学的技术关键点

1、肽段选择策略

• 唯一性（只来自目标蛋白）
• 良好的离子化效率
• 稳定、不含修饰或易降解位点

2、内标引入与定量方法

• 相对定量：基于肽段峰面积比较
• 绝对定量：加入稳定同位素标记肽（SIS）校正系统误差

3、标准化实验流程

• 样本处理（提取、酶解、净化）
• 仪器参数优化（碰撞能、保留时间窗口）
• 软件分析（Skyline、Spectronaut 等）

三、靶向蛋白质组学的优势与局限

1、优势

2、局限性

* 需要先验信息，无法用于未知蛋白发现

• 方法开发仍需优化过程，尤其MRM的转移选择

四、靶向蛋白质组学的典型应用场景

1、疾病生物标志物验证

• 癌症早筛：如乳腺癌中PRM验证候选蛋白
• 自身免疫病标志物评估
• 心血管病高风险人群分型

2、药物靶点与疗效评估

• 监测药物对信号通路关键蛋白的表达调控
• 多时间点PRM监控治疗动态变化

3、液体活检与复杂样本分析

• 靶向蛋白组学适合血浆、尿液、脑脊液等
• 可识别极低丰度的肿瘤来源蛋白

4、合成生物与细胞工厂监测

• 精准定量代谢通路关键酶
• 辅助微生物蛋白表达调控与优化

五、百泰派克生物科技的靶向蛋白组服务特色

百泰派克生物科技构建了涵盖 MRM、PRM 及 DIA/SWATH 技术的完整服务平台，满足科研及转化研究的多样化需求：

• 多平台支持：Agilent 6495、SCIEX QTRAP 三重四极杆平台；Orbitrap Exploris 高分辨PRM平台；支持SWATH数据采集与谱库构建；
• 方法开发灵活：提供靶点筛选、SIS肽设计与定制等个性化服务；
• 标准化流程控制：从样本处理到数据分析全流程质量管理；
• 支持DIA与靶向联合分析：助力候选蛋白从发现到验证的闭环研究。

靶向蛋白质组学作为蛋白定量分析的重要工具，正在成为连接基础研究与转化应用的桥梁。通过合理选择MRM、PRM或SWATH策略，科研人员可根据研究目标实现对关键蛋白的灵敏、稳定、可重复的定量检测。百泰派克生物科技致力于为研究者提供高质量、高可信度的靶向蛋白质组学服务，推动疾病机制研究、生物标志物验证与生物药研发的深入发展。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

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6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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